تأسس مركز حقوق الإنسان لمساعدة السجناء عام 1997 كشركة أهلية ، غير هادفة للربح ، نشاط غير سياسي ، تهدف إلى تقديم المساعدة القانونية للسجناء والمطالبة بإصلاح السجون لتصبح مناسبة للإصلاح وإعادة التأهيل ، ومع صدور قانون الجمعيات الأهلية رقم 84 لسنة 2002 كان مركز توفيق أهلية للجمعيات وفق هذا القانون وتم إيداعه برقم 1820/2003 مع التنبيه على أن هذا النجاح فقط على الشكل القانوني للمؤسسة كان مركزاً ولم يركز. على أي من أنشطتها التي استمرت دون تغيير.